Введённые в 2014 году западными странами антироссийские санкции негативным образом повлияли на экономику не только России, но и её партнеров по будущему Евразийскому экономическому союзу. Ярким примером, иллюстрирующим данную ситуацию, было снижение экономических показателей в Казахстане в 2015 году. В результате достаточно резкого ослабления курса российского рубля произошла потеря курсовой конкурентоспособности казахстанских производителей, что, с учётом структуры двусторонних торговых отношений, привело не только к росту физических объёмов ввоза российских товаров, но и к снижению казахстанского экспорта в целом. Позднее курс казахстанского тенге удалось скорректиро-вать за счёт его отпуска в свободное плавание, но это вызвало недовольство населения и даже акции протеста в республике.
В 2015 году в связи с кризисными явлениями в российской и казахстанской экономиках, вызванными, конечно, не только санкциями, но и серьёзным снижением мировых цен на нефть, произошёл спад и киргизской экономики. Ослабление экономик Российской Федерации и Казахстана, где в основном работают мигранты из Кыргызской республики, уменьшило приток денежных переводов в эту страну (чистый приток денежных переводов физических лиц в 2015 году снизился на 25,8 процента к показателям 2014 года), а также привело к замораживанию в республике многих инвестиционных проектов. Самым болезненным для Киргизии стал отказ России от строительства крупнейших объектов — Камбаратинской ГЭС-1и Верхненарынского каскада гидроэлектро-станций.
От санкций и снижения цен на сырьевые ресурсы, а также замедления мировых экономик пострадали абсолютно все страны Союза, особенно это отразилось на взаимной торговле. По данным Евразийской экономической комиссии, физический объём взаимной торговли в 2015 году сократился к уровню 2014 года на 7,5 процента, а стоимостной показатель снизился более радикально — на 25,5 процента. Сокращение стоимостного показателя на 70 процентов произошло за счёт падения цен на товары, на 30 процентов — за счёт снижения товарной массы. В 2016 году ситуация несколько улучшилась. Товарная масса взаимной торговли увеличилась на 0,4 процента, но стоимостной объём продолжал снижаться. Это снижение в 2016 году определил исключительно ценовой фактор. В итоге объём взаимной торговли Евразийского экономического союза за январь — декабрь 2016 года составил лишь 93,3 процента к уровню соответствующего периода 2015 года. По минеральным продуктам показатель снизился на 24 процента, машинам, оборудованию и транспортным средствам — на 1,5 процента, металлам и изделиям из них — на 1,3 процента.
Таким образом, создание Евразийского экономического союза проходит в условиях неблагоприятной экономической конъюнктуры, но тем не менее интеграционный процесс не прерывается.
Дополнительные проблемы возникли в результате ответных действий России на санкции западных стран. Контрмеры российской стороны не были обсуждены и одобрены партнёрами по Союзу, что пошло вразрез основополагающим принципам интеграционного объединения, подразумевающим соглаованные действия не только внутри организации, но и единую позицию по отношению ко внешним участникам торговли. Подписывая договор, стороны обязывались не только гарантировать свободное перемещение товаров, услуг, капиталов и рабочей силы, но и осуществлять согласованную деятельностьв ключевых отраслях экономики, таких как энергетика, промышленность, сельское хозяйство и транспорт. Именно эти базовые пункты соглашения и были нарушены.
Контрсанкции России привели к тому, что запрещённая европейская продукция стала появляться на российском рынке под видом белорусской и казахстанской, в меньшей степени — армянской и киргизской. «Белорусские» креветки уже стали притчей во языцех. Это вызвало раздражение Москвы и новые скандалы. В своём интервью одному из телеканалов 6 апреля 2017 года Александр Лукашенко, комментируя данную ситуацию, выразил уверенность в том, что реэкспортом санкционных товаров занимаются вовсе не белорусы, а российские «бандиты».